用药时机把握不准。打药必须抓住时机，只有了解病虫草害的发生规律，适时用药，方能奏效。
施药方法不当。田间病虫草害的发生和害虫的栖息，在作物上都有一个为害部位。农药这支“箭”应该射中为害部位的“靶”。
病虫草抗性增加。随着农药用量的迅速增加和品种的不断更替，病虫草抗药性也日趋加剧，特别是粮、油、菜、茶、果等主要作物，用药频繁，病虫草抗药性更是几倍、几十倍的增加。
防治对象不明确。病当虫打、虫以病杀、草做虫除，这种现象普遍存在。如棉花现蕾后发生的红叶枯病，人们常误认为是红蜘蛛为害进行防治。
喷施药液浪费大。目前，我国农村普遍使用的喷药器具，雾粒粗、防效差、不安全。据测定，这种喷雾法，黏着性差，沉积率低，还严重污染了环境。所以，应积极推广低容量喷雾、超低量喷雾、弥雾、静电喷雾等新的机具和技术。
农药自身的局限。有些农药对某些病虫草害有良好的防治效果，但对另一些病虫草害却无能为力，防效极差。
施药时间未把握好。如菜粉蝶、菜青虫成虫、棉大卷叶蛾、稻蝗等都喜欢在光照充足的白天活动，而鳞翅目夜蛾和部分螟蛾科害虫都是在晚上活动、交配、产卵。因此，按时用药才能达到最佳的防治效果。
